Para não perder as pendências do aluno, coloque as informações dessa(s) pendência(s) no campo “Observação”.dentro da ficha do aluno. Veja como:

1) Vá na ficha do aluno

2) Clica na foto dele

3) Vá na aba “Informações complementares” e coloque as pendências no campo “Observação” 

Obs: Tudo que será colocado no campo “observação” ficará no histórico do aluno. Mesmo depois de cancelar a matrícula, o histórico não será perdido.

4) Dê baixa na(s) pendência(s) em atraso.

5) E por fim cancele a matrícula do aluno clicando na aba “Matrícula” >> “Cancelamento de Matrícula”.